Die Senatsverwaltung für Mobilität, Verkehr, Klimaschutz und Umwelt ist oberste Verkehrsbehörde für die nichtbundeseigenen Eisenbahnen im Land Berlin. Dies betrifft in erster Linie Unternehmen und Organisationen, die Eisenbahnen betreiben.
Die technische Aufsicht wird durch die Abteilung Mobilität, IV E 3, wahrgenommen. Dieser Bereich ist unter anderem auch zuständig für die Zulassung von Eisenbahnunternehmen, den Ausgleich betriebsfremder Aufwendungen oder die Zulassung zur Prüfung zum Eisenbahnbetriebsleiter.