Es wird davon ausgegangen, dass die Häufigkeit von FASD ca. ein Prozent aller Kinder ausmacht. Für einzelne Gruppen mit spezifischen Risikofaktoren ergibt sich eine wesentlich höhere Häufigkeit. Man nimmt beispielsweise an, dass jedes fünfte Kind in einer Einrichtung der stationären Jugendhilfe ein FASD hat.
Primäre Störungen entstehen in der Schwangerschaft durch das Toxin Alkohol. Hierbei können Organe und Gesichtsformen betroffen sein. Im Bereich Schule spielen aber besonders die Schädigungen eine Rolle, die die Exekutivfunktionen einschränken, die wir für eine planvolle Interaktion im Alltag benötigen.
Dazu gehören Gedächtnis, Impulssteuerung, Prozessdenken, Arbeitsgeschwindigkeit, Handlungsplanung, Abstraktionsvermögen, Konzentration und kognitive Flexibilität.
Sekundäre Störungen werden nicht durch das Toxin Alkohol verursacht. Sie entstehen bei FASD dadurch, dass Menschen mit ihren unsichtbaren primären Einschränkungen der Hirnfunktionen an den Anforderungen der Umwelt scheitern. Wird dem mit Hypothesen begegnet wie „das Kind ist faul“ oder „das Kind ist schlecht erzogen“, lösen diese Erfahrungen Schäden im Selbstbild aus, die in psychische Störungen (wie Depression), in suizidale Gedanken oder eine Störung des Sozialverhaltens münden können. Auch die offene Stigmatisierung der leiblichen Mutter kann solche sekundären Prozesse auslösen.