Die Städtepartnerschaften Friedrichshain-Kreuzbergs werden durch fünf ehrenamtliche Vereine mitgestaltet. Sie organisieren Veranstaltungen, führen Projekte durch und laden Bürger*innen des Bezirks jederzeit ein, sich zu engagieren.
Der Verein zur Förderung der Städtepartnerschaft Kreuzberg – San Rafael del Sur e.V. betreut seit 1984 die Städtepartnerschaft mit San Rafael del Sur in Nicaragua.
Der Partnerschaftsverein Berlin – Friedrichshain-Kreuzberg e.V. betreut seit 1986 die Partnerschaften mit Wiesbaden, Porta Westfalica, dem Kreis Bergstraße, Ingelheim am Rhein und dem Kreis Limburg-Weilburg in Deutschland sowie mit Kiryat Yam in Israel.
Städtepartner Stettin e.V. betreut seit 1997 die Städtepartnerschaft mit Stettin in Polen und mit Oborischte (Sofia) in Bulgarien.
Der Städtepartnerschaftsverein Kadıköy e.V. betreut seit 1998 die Partnerschaft mit Kadıköy (Istanbul) in der Türkei.
Der Städtepartnerschaftsverein Friedrichshain-Kreuzberg – Derik e.V. betreut seit 2018 die Partnerschaft mit Dêrik in Syrien.