Die für Gesundheit zuständige Senatsverwaltung vertritt dabei das Land Berlin und stimmt sich insbesondere mit den bezirklichen Vertreterinnen und Vertretern ab. Dazu gehören die Stellen für Qualitätsentwicklung, Planung und Koordination des öffentlichen Gesundheitsdienstes sowie weiteren Ressorts wie Bildung, Jugend, Sport, Stadtentwicklung und Wohnen oder Pflege.
Im Juli 2023 hat der Verband der Ersatzkassen (vdek) mit Unterstützung durch den BKK Landesverband die für Gesundheit zuständige Senatsverwaltung bei der Wahrnehmung der Geschäftsstellenfunktion der LRV abgelöst. Der vdek übernimmt diese Aufgabe für die nächsten zwei Jahre.