Nicolai Panzer verfügt über langjährige Erfahrung in der Verwaltungsgerichtsbarkeit sowie in der Justiz- und Verwaltungsarbeit.
Nach seiner Ernennung zum Richter auf Lebenszeit am Verwaltungsgericht Frankfurt (Oder) im Jahr 2001 war er zunächst an das Ministerium für Europaangelegenheiten des Landes Brandenburg abgeordnet.
Nach seiner Rückkehr an das Verwaltungsgericht Frankfurt (Oder) im Jahr 2003 folgten weitere Stationen, darunter eine Abordnung an das Bundesverfassungsgericht im Jahr 2006 und an das Verwaltungsgericht Cottbus im Jahr 2009.
Ab 2011 war er Richter am Oberverwaltungsgericht Berlin-Brandenburg. Im Jahr 2015 war er an das Ministerium der Justiz und für Europa und Verbraucherschutz des Landes Brandenburg abgeordnet.
Zuletzt war er von 2024 bis Juli 2026 Vorsitzender Richter am Oberverwaltungsgericht Berlin-Brandenburg