Dans la Collection des Antiquités, l’autel de Pergame, du 2ème Siècle avant J-C, considéré comme un chef d’œuvre de la période hellénistique, présente une frise dépeignant un combat entre les Dieux et les Géants. La porte de l’agora de Milet constitue un exemple majeur de l’architecture romaine.
Le Musée des Antiquités du Proche-Orient, qui figure parmi les plus belles collections du monde pour cette région, est dominé par l’imposante porte d’Ishtar de Babylone, datant du 6ème siècle avant J.-C, et faite de briques bleutées. La porte est décorée de dragons, de lions et de taureaux symbolisant les divinités majeures de Babylone. Un mur transparent en second plan permet aux visiteurs de voir comment l’énorme porte fut reconstituée à partir de fragments. A voir également dans cette collection, la façade de la salle du trône du roi Nabuchodonosor, un palais néo-assyrien du 12ème siècle avant J.-C.- reconstitué et des objets provenant des premiers temps de l’écriture.
Le musée d’Art islamique a été créé en 1904 à partir d’une donation de tapis précieux par Wilhelm von Bode. De telles pièces constituent encore la majeure partie de l’exposition, avec des exemplaires vivement colorés provenant d’Iran, d’Asie mineure, d’Egypte et du Caucase. Les pièces maitresses de la collection d’Art et d’Artisanat islamique du 8ème au 19ème siècle incluent la salle d’Alep, du 17ème siècle, une pièce aux panneaux peints de couleurs vives appartenant à la maison d’un marchand de la ville syrienne d’Alep, décorée de poèmes arabes et perses, de dictons et d’images de personnes, de plantes et d’êtres mythologiques. Une restauration importante du Musée de Pergame est en cours, mais le musée reste ouvert durant les travaux.